早期花窗玻璃多以圣经故事为内容，以光线配合图案的效果感动信徒。而一些教会所在地本地的传说和神话，也会进入其主题之中。近代以来，花窗玻璃彩色玻璃不仅出现在教堂，也在许多一般建筑、室内空间、产品中获得应用。
彩绘玻璃作为一种创意十足的艺术形式，最初的形成是依靠建筑结构系统的演变，哥特式教堂的肋梁，减轻了拱顶的重量，协调各构件之间的关系，将教堂重量转移到外部地基上，从而摆脱了厚重的墙体，减轻了建筑的负担，所有这些因素都使得大面积窗户得以实现
七世纪时，欧洲各地的教堂都使用彩色玻璃，手工制作基督教经文，也是主要产自西欧，之后也是通常用彩色墨水用来装饰，一些十三世纪的彩色玻璃作品也是有很多模仿之前的工艺制品