教堂的另外一个重点是彩色玻璃，在教堂内的彩色玻璃都非常特别，用玻璃制作图像台凸显出圣经里的人物或是故事，如为基督教徒会被这里的彩色玻璃所吸引，在教堂内部总共有56个玻璃窗，31个圆形的玫瑰图案以及25个彩色幅彩色玻璃窗的精美图案，但是在这56个玻璃窗只有4个是最完整无瑕的，其它的玻璃窗都是在1949-1951由当地主教的居民进行一些整修，而这些彩色玻璃窗都是由法国沙特尔省的LorinFirm所制造。
彩绘玻璃大家都熟悉，做工精致、五彩缤纷，印象中相关场景，大多出现在宗教建筑上比如教堂、修道院等。国师电影《金陵十三钗》中彩绘玻璃就是一个重要的道具，色彩鲜艳、五彩斑斓，阳光照射进来，反射出不同的光线，将美轮美奂表现到极致。